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进化树也能顾盼生姿
最近需要画一张包含进化树和不同基因GC含量的图，研究了一番，觉得用热力图表示GC含量比较合适一点。可以完成这项工作的工具其实有很多，今天主要分享两种比较常见和好用的工具，其一是ITOL网页版工具，其二是R里的ggtree包（Y叔出品，值得安利）。 ITOLITOL是一款非常强大的进化树注释，修饰，展示的工具，文章的摘要如下： Interactive Tree Of Life (http:/... -
值得过的一生
Three passions, simple but overwhelmingly strong, have governed my life: the longing for love, the search for knowledge, and unbearable pity for the suffering of mankind. These passions, like grea... -
雨行走在三个人中
脚踩着一团柔软风和雨把头埋的很低很低低到可以看到满地的月亮一遍遍地被揉碎在这河流里 训斥声从头顶传来我不敢抬头，心里默数着犯下的错误含羞草也收紧了枝叶不远处传来一缕清香那是九里香的味道我知道，我快到家了。 -
使用Getopt::Long变量赋值为0时的尴尬
perl 使用 Getopt::Long 模块的时候，你想给两个参数设置默认值，比如：a,b参数, $a ||= 2， $b ||= 1 一眼看上去好像没什么问题。如果你不赋值给这两个参数，那么$a的值为2，$b为1. 但如果你想将a,b的值设置为0的时候，问题就来了：$a ||= 2， $b ||= 1 这样写实际的传递过程是：先判断“||”左边的值的真假，虽然你是已经给a,b赋值了，但是... -
insomnia in summer
夏日无眠蛙鸣汤沸不知倦，花开荼蘼夏日喧。 只说无愁复入眠，辗转难寐数星峦。 -
Poem-Part1
你是人间的四月天（改写于Mar 13, 2011）原文： 我说 你是人间的四月天； 笑响点亮了四面风； 轻灵在春的光艳中交舞着变。 你是四月早天里的云烟， 黄昏吹着风的软， 星子在无意中闪， 细雨点洒在花前。 那轻，那娉婷，你是， 鲜妍百花的冠冕你戴着， 你是天真，庄严， 你是夜夜的月圆。 雪化后那片鹅黄，你像； 新鲜初放芽的绿，你是； 柔嫩喜悦， 水光浮动着你梦期待中白莲。 你是一树一树... -
更改fasta序列每一行显示的碱基数目
一个Perl小程序1234567891011121314151617181920#!/usr/bin/perl -wuse strict;die "perl $0 <*.fa> <number of one line>" unless (@ARGV == 2) ;my $genome=shift;my $num = shift;open (IN,$... -
春日袭雾
春日袭雾花寻山涧中， 鸟鸣绿屏踪。 雾散苔痕近， 似有人问gene。 -
孤独
孤独孤独这两个字拆开看，有小孩，有水果，有走兽，有蚊蝇，足以撑起一个盛夏傍晚的巷子口，人味十足。夏日的傍晚，你看着嗡嗡飞舞的蝇虫，不远处的狗摇着尾巴穿巷而过，你手中拿着吃剩下的半块西瓜，忽然觉得过了半辈子，又好像只过了半分钟。 在朋友的一篇文章中看到的，觉得这段文字十分的美！click here => 好日子会闪闪发光
